Kanal tedavisine rağmen kök ucunda iyileşmeyen dokuların varlığında, kanal tedavili dişlerde sürekli yineleyen ağrı veya enfeksiyon varlığında, çene kistleri ile etkileşen dişlerin ağızda kalması amacıyla, sağlıklı bir kanal tedavisini engelleyen anatomik veya patolojik durumların varlığında apikal rezeksiyon tercih edilebilir. Bu işlem sayesinde hastanın kendi dişinin çekilmeden sağlıklı bir şekilde ağız içinde fonksiyonda kalması sağlanır.